More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1168 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 71 aa  147  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  92.96 
 
 		 71 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05825  translation initiation factor IF-1  90.14 
 
 		 71 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  88.73 
 
 		 72 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4365  translation initiation factor IF-1  87.32 
 
 		 72 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  80.28 
 
 		 72 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  84.51 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.959499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  74.65 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  70.42 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  71.83 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 75 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  72.46 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  70.42 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 75 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 75 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 73 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  68.57 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 73 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  67.61 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 74 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 80 aa  107  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  69.57 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 73 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 73 aa  105  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  60.56 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>