More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4365 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4365  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  148  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 		 72 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 		 72 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.959499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  87.32 
 
 		 71 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  87.32 
 
 		 71 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05825  translation initiation factor IF-1  84.51 
 
 		 71 aa  128  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  65.28 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  68.06 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  66.67 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 75 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 75 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  63.89 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 73 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  103  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  65.71 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  62.5 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>