More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1578 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 		 72 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  130  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 75 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  83.33 
 
 		 72 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  83.33 
 
 		 72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  81.94 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  79.45 
 
 		 73 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  80.56 
 
 		 72 aa  124  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  123  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 		 73 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 		 73 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 83 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 		 73 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  78.08 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 		 73 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  120  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  120  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  75.34 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  76.71 
 
 		 73 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  80.82 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 		 73 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 		 73 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  78.08 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  78.08 
 
 		 73 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3674  translation initiation factor IF-1  76.71 
 
 		 111 aa  116  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 		 73 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6026  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0605  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  116  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  115  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>