More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1461 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  87.32 
 
 
83 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  126  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  83.82 
 
 
71 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  120  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
73 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
74 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  75 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
74 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  75 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
73 aa  116  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  75 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 
73 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  115  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  69.86 
 
 
73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  68.06 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
78 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
78 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4936  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000594516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1947  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
77 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
77 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  68.49 
 
 
116 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>