More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0071 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0074  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 		 72 aa  143  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 		 72 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 		 72 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 		 72 aa  136  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 		 72 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 		 72 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 		 72 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000294229  hitchhiker  0.0000161331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  122  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0349  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0489809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0519  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159478  unclonable  0.0000000000136175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0340  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000179995  unclonable  0.0000000353194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 73 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  69.44 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  68.06 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  66.67 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>