More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0203 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  95.83 
 
 
72 aa  141  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 
72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 
72 aa  137  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  73.61 
 
 
85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
73 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 
83 aa  114  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
72 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0674  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4365  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
72 aa  110  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl146  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
78 aa  110  8.000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000119077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  63.89 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 
73 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1947  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4936  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
73 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000594516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
77 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
77 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 
73 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 
71 aa  106  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
75 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.959499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
75 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 
73 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 
71 aa  106  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
74 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  67.14 
 
 
72 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
74 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>