More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0711 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  97.3 
 
 
74 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  94.59 
 
 
75 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  94.59 
 
 
75 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3723  translation initiation factor IF-1  96.97 
 
 
67 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  76.71 
 
 
73 aa  123  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  72.22 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
72 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
83 aa  114  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
72 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  67.57 
 
 
75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
78 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  70 
 
 
87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
78 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
72 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
71 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1756  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2439  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
73 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
72 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
72 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 
74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>