More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1845 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1845  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
99 aa  201  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2884  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  120  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342114  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2596  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
72 aa  116  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0656531  normal  0.651442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  72.73 
 
 
73 aa  107  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 
72 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  55.7 
 
 
80 aa  103  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 
73 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 
73 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  62.32 
 
 
73 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  63.64 
 
 
73 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 
72 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  62.32 
 
 
73 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 
73 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 
72 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  63.64 
 
 
73 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  63.64 
 
 
73 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  72.31 
 
 
73 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 
72 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  54.35 
 
 
116 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
73 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
72 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  70.77 
 
 
73 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 
73 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 
72 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  64.62 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  72.31 
 
 
73 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  72.31 
 
 
73 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  72.31 
 
 
73 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  60.56 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
72 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  70.77 
 
 
73 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 
73 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 
73 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  62.32 
 
 
72 aa  98.2  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 
74 aa  97.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
72 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
72 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
72 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  60.87 
 
 
74 aa  97.4  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  65.15 
 
 
73 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  69.23 
 
 
73 aa  97.1  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  58.82 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  67.19 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 
72 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1003  translation initiation factor IF-1  60 
 
 
83 aa  97.1  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000130105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  70.77 
 
 
73 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  70.77 
 
 
73 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  64.06 
 
 
72 aa  96.7  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  67.19 
 
 
73 aa  96.7  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
72 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 
73 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  62.12 
 
 
72 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000294229  hitchhiker  0.0000161331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
72 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  67.19 
 
 
73 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  63.93 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  70.77 
 
 
73 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
72 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  57.14 
 
 
74 aa  95.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 
73 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16940  translation initiation factor 1  69.23 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  60.29 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6588  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 
73 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>