More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0253 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0253  NusG antitermination factor  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000116635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0303  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 265 aa  258  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000020407  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  45.16 
 
 		 185 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  43.85 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  45.6 
 
 		 176 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  46.83 
 
 		 177 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  39.04 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  39.04 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  48.74 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  47.54 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  43.05 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  42.74 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  42.74 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  42.38 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  42.74 
 
 		 176 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  43.55 
 
 		 176 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  38.69 
 
 		 177 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  38.69 
 
 		 177 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  45.24 
 
 		 177 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  40.58 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  42.76 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  40.58 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  44.27 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  40.13 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  40.58 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  40.58 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  41.73 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  42.76 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  39.73 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  45.9 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  45.9 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  41.78 
 
 		 177 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  38.61 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  41.78 
 
 		 177 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  41.94 
 
 		 176 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  41.73 
 
 		 193 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  41.3 
 
 		 176 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  40.4 
 
 		 199 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  42.74 
 
 		 199 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  44.72 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  39.86 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  40.12 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 176 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  41.35 
 
 		 174 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  44.26 
 
 		 181 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  40.41 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  40.41 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  40.41 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  41.94 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  40.41 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  38.82 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  40.32 
 
 		 176 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  42.42 
 
 		 175 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  41.94 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  40.43 
 
 		 179 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  43.97 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  40.41 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  43.97 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  41.94 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  41.94 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  42.62 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  43.97 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  41.8 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  38.16 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06110  transcription termination/antitermination factor NusG  42.07 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  38.16 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  44.26 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  42.4 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>