28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0937 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  776    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  34.11 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  32.34 
 
 		 390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  32.34 
 
 		 390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  33.98 
 
 		 347 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  33.7 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  32.87 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  32.87 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  29.09 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  28.8 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  28.8 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  30.08 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  27.55 
 
 		 407 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  27.55 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  27.55 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  26.8 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  25.26 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  24.74 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0045  hypothetical protein  27.3 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  20.98 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  26.48 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1713  hypothetical protein  30.47 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000607675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1972  hypothetical protein  26.59 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  24.31 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2087  hypothetical protein  27.74 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  23.47 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>