More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0275 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0275  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000428064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0281  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  161  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000523315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  56.2 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  56.2 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  143  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  140  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  54.55 
 
 
122 aa  137  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  54.92 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  137  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  54.55 
 
 
121 aa  137  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1625  ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  137  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  136  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  55.74 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  59.02 
 
 
122 aa  135  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  55.74 
 
 
162 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000117206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000152451  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  54.1 
 
 
122 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  52.07 
 
 
121 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1236  50S ribosomal protein L14  54.55 
 
 
123 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.438717  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  134  5e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  53.28 
 
 
122 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  54.47 
 
 
123 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  52.89 
 
 
122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  133  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  54.1 
 
 
122 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  52.46 
 
 
122 aa  133  9e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  133  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  133  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17301  50S ribosomal protein L14  52.07 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.38809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  54.1 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  53.28 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  54.1 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  53.28 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  54.92 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17391  50S ribosomal protein L14  51.24 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0611  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00801409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>