More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0485 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000152451  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000117206  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0611  50S ribosomal protein L14  95.9 
 
 
122 aa  235  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00801409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  234  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  234  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  234  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  233  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  86.07 
 
 
162 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  220  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  219  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  219  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  219  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000810078  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0060  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000171332  hitchhiker  1.54022e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  217  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  217  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0777  ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  216  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000394728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  209  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  208  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  206  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  206  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  204  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  204  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  83.05 
 
 
119 aa  203  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  79.51 
 
 
122 aa  201  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  200  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  200  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  195  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000280121  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000168914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  78.05 
 
 
123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0347  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  194  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1844  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0430762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000028271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000101155  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0338  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
160 aa  193  7e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.47925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000141408  unclonable  0.0000000000497407 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  74.8 
 
 
123 aa  192  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000146326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0158  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  192  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000251869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000995848  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000182968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000176442  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278183  unclonable  0.0000000000139083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000238487  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000123635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
123 aa  191  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  76.42 
 
 
123 aa  191  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000092381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06350  50S ribosomal protein L14  79.13 
 
 
116 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  75.61 
 
 
123 aa  190  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>