20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0319 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1014    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  33.96 
 
 		 485 aa  90.9  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  33.96 
 
 		 485 aa  90.9  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  26 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  31.48 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  31.48 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  23.34 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  24.74 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  23.62 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  24.47 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  22.98 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  23.24 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  49.06 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  61.54 
 
 		 552 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  41.54 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  54.35 
 
 		 446 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  34.62 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  39.29 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3445  hypothetical protein  47.37 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00254037  normal  0.641592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  60.71 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>