More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1007 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1007  ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1729  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  52.52 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  49.28 
 
 		 144 aa  156  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 149 aa  151  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  52.34 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  52.34 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  52.34 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  48.57 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  51.06 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  47.14 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  48.57 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  50.74 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  51.49 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  51.09 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  49.28 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  47.55 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  47.83 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  49.26 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  47.83 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  49.3 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  48.92 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>