More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2148 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.01 
 
 		 405 aa  817    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  100 
 
 		 405 aa  825    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  71.46 
 
 		 408 aa  548  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.94 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 479 aa  196  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 421 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 419 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  29.31 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 436 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  30.58 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.45 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  29.81 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 419 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  28.15 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  26.78 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  30.51 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  26.67 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1843  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  29.72 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  29.68 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  28.47 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  29.62 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 476 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 476 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  27.49 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  27.34 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  27.78 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  31.16 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  31.25 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  28.21 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  28.92 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  27.88 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  26.29 
 
 		 463 aa  99.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 464 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  29.8 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 433 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  28.61 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 436 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 462 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  28.29 
 
 		 449 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  25.25 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4042  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  27.34 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  29.36 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>