More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1586 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  100 
 
 		 419 aa  830    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  38.52 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  35.67 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  39.69 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  39.9 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  39.05 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  38.81 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  37.38 
 
 		 451 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  36.43 
 
 		 442 aa  229  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  35.39 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.92 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  34.72 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  32.69 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  34.36 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 436 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 443 aa  202  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  30.24 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  35.04 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 476 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 476 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  33.07 
 
 		 426 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  30.57 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  33.16 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  29.72 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  31.75 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  31.35 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 449 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  33.66 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  29.57 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  31.41 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  29.19 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  34.38 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  31.03 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 463 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  29.29 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  29.07 
 
 		 440 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.916749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  32.86 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0133  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289635  decreased coverage  0.00139676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>