More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0039 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 448 aa  878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 448 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  87.72 
 
 		 448 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  54.25 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.4 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  47.24 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  47.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  47.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  47.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  47.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  47.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  47.24 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  47 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 		 467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  45.19 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 		 468 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  33.25 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 418 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  34.35 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.25 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  29.01 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  34.12 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  28.87 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 419 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  30.09 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  30.94 
 
 		 452 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  29.6 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  28.86 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  30.37 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  27.21 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  29.16 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 408 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 405 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  30.07 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  29.45 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  29.02 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  28.33 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  28.54 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  29.1 
 
 		 429 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 423 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1843  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  25.53 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  29.92 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  25.53 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0064  two component sensor kinase  26.87 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  25.49 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  27.2 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0601  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.4 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>