27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2249 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  100 
 
 		 830 aa  1710    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  44.8 
 
 		 873 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  44.19 
 
 		 746 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  44.07 
 
 		 746 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  50.72 
 
 		 752 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  34.18 
 
 		 713 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.72 
 
 		 521 aa  180  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  51.94 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  32.38 
 
 		 651 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  32.03 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  23.23 
 
 		 805 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  24.38 
 
 		 743 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.44 
 
 		 659 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  26.05 
 
 		 899 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.21 
 
 		 899 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.45 
 
 		 303 aa  90.9  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.39 
 
 		 843 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  23.46 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3769  hypothetical protein  42.7 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330863  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0745  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.42 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  23.15 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.59 
 
 		 557 aa  57  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  24.55 
 
 		 307 aa  53.9  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.32 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  22.45 
 
 		 306 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  29.13 
 
 		 657 aa  44.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>