26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3557 on replicon NC_009470
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 635 aa  1280    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  29.44 
 
 		 805 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  27.9 
 
 		 651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  27.57 
 
 		 650 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.25 
 
 		 899 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  28.41 
 
 		 899 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  23.68 
 
 		 873 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.09 
 
 		 843 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.06 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  24.53 
 
 		 743 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0051  relaxase  38.1 
 
 		 1201 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  21.85 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  23.45 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  23.62 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  20.9 
 
 		 713 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  24.28 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  23.94 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  33.7 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  33.71 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  30.38 
 
 		 1255 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  26.83 
 
 		 657 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  31.37 
 
 		 307 aa  48.5  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.03 
 
 		 392 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.03 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.92 
 
 		 315 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.92 
 
 		 307 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>