43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_B2797 on replicon NC_007615
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  831    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  42.77 
 
 		 557 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  36.09 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0596  hypothetical protein  32.98 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1974  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.69 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0544  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.28 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.996165 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  41.11 
 
 		 899 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5148  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.63 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  40 
 
 		 899 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  23.46 
 
 		 830 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.95 
 
 		 743 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  27.39 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  32.04 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  35.56 
 
 		 650 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  35.56 
 
 		 651 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0728  hypothetical protein  28.65 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  26.7 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.71 
 
 		 635 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3789  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.35 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.23 
 
 		 306 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.57 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.78 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.41 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  41.82 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  28.89 
 
 		 746 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  28.89 
 
 		 746 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  24.82 
 
 		 752 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.15 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.71 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  27.92 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.92 
 
 		 843 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0832  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.68 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.9 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.9 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0029  rlx protein, putative  37.8 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.54 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  34.43 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  31.15 
 
 		 873 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.95 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  22.11 
 
 		 807 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  37.1 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>