22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2533 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 659 aa  1363    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  29 
 
 		 743 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  27.48 
 
 		 805 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  22.53 
 
 		 713 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  24.39 
 
 		 873 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  24.86 
 
 		 752 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  25 
 
 		 830 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  25.05 
 
 		 746 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  25.95 
 
 		 651 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  24.66 
 
 		 746 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  25.52 
 
 		 650 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.17 
 
 		 843 aa  97.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  25.24 
 
 		 650 aa  94.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.11 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  34.65 
 
 		 899 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.24 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  34.65 
 
 		 899 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  37.89 
 
 		 557 aa  60.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  20.45 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.19 
 
 		 307 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.87 
 
 		 306 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  31.87 
 
 		 398 aa  44.3  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>