24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_A3574 on replicon NC_007515
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 743 aa  1512    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  29.07 
 
 		 805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  29 
 
 		 659 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  31.38 
 
 		 650 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  30.96 
 
 		 651 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  26.88 
 
 		 713 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.96 
 
 		 521 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  37.23 
 
 		 899 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  36.5 
 
 		 899 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  25.29 
 
 		 650 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  23.33 
 
 		 873 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  24.38 
 
 		 830 aa  94.7  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  25.27 
 
 		 752 aa  94  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.63 
 
 		 843 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  28.26 
 
 		 746 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  28.26 
 
 		 746 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.53 
 
 		 635 aa  70.5  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  32.59 
 
 		 557 aa  62.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.95 
 
 		 398 aa  62  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.49 
 
 		 303 aa  60.1  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5148  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.39 
 
 		 424 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.72 
 
 		 307 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.74 
 
 		 281 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0544  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.61 
 
 		 562 aa  43.9  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.996165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>