28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NmulC_2790 on replicon NC_007616
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1140    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  42.77 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.07 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  41.98 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  41.98 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  38.95 
 
 		 899 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  36.67 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  32 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  32 
 
 		 746 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  29.37 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  32.59 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  31 
 
 		 752 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  27.78 
 
 		 873 aa  60.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  34.74 
 
 		 899 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.7 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.91 
 
 		 843 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  27.59 
 
 		 830 aa  57  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  28.4 
 
 		 713 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  28.24 
 
 		 307 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1758  Relaxase/mobilization nuclease family protein  41.89 
 
 		 443 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.562908  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.23 
 
 		 315 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.76 
 
 		 281 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.56 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.56 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.91 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.73 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  32.76 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>