41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2322 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  26.92 
 
 		 873 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  27.45 
 
 		 830 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  30.2 
 
 		 650 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  30.2 
 
 		 651 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  36.09 
 
 		 398 aa  85.5  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  22.57 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  26.15 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  26.15 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  34.07 
 
 		 557 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  30.58 
 
 		 899 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  26.09 
 
 		 752 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.06 
 
 		 635 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  33.54 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.8 
 
 		 899 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  34.21 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.13 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.01 
 
 		 807 aa  66.2  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  26.61 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  29.92 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.34 
 
 		 843 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.71 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  23.5 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.8 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  24.49 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.31 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.17 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.83 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.67 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.42 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  24.34 
 
 		 443 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24 
 
 		 521 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.78 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.31 
 
 		 464 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.39 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0029  rlx protein, putative  30.08 
 
 		 338 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.24 
 
 		 659 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1250  Tn5252, relaxase  22.15 
 
 		 621 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  26.09 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4196  Relaxase/mobilization nuclease family protein  19.88 
 
 		 423 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0933  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.97 
 
 		 425 aa  42.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.978324  normal  0.238537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>