56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5231 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.43 
 
 		 490 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  23.73 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.95 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.22 
 
 		 807 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.72 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.85 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.74 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.74 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  26.42 
 
 		 830 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.76 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.76 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.13 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.32 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  21.52 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  23.26 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  27.27 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.7 
 
 		 431 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3761  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.04 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  37.04 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  24.89 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.43 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.53 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  29.9 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.58 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.99 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6240  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.17 
 
 		 514 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4196  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.82 
 
 		 423 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0029  rlx protein, putative  28.33 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3563  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.52 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  27.43 
 
 		 873 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0321  hypothetical protein  29.91 
 
 		 510 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0180  hypothetical protein  31.68 
 
 		 484 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0133176 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  25.22 
 
 		 752 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  31.46 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1758  Relaxase/mobilization nuclease family protein  23.23 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.562908  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  41.82 
 
 		 398 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.57 
 
 		 458 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1610  Relaxase/mobilization nuclease family protein  22.94 
 
 		 444 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  25.13 
 
 		 443 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.4 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  24.64 
 
 		 746 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  24.17 
 
 		 746 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4335  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.96 
 
 		 519 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  22.62 
 
 		 843 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A11  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.11 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4380  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.14 
 
 		 416 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  32.76 
 
 		 557 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  36.36 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.13 
 
 		 464 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.74 
 
 		 743 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0050  relaxase  21.67 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.699797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.1 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  28.4 
 
 		 805 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  26.14 
 
 		 899 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  25 
 
 		 899 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>