39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3018 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 426 aa  888    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  48.28 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  31.38 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4196  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.24 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.307689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3654  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.25 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3761  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.23 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.49 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3563  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.69 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4380  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.37 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.46 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.01 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  30.15 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.85 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.61 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.61 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.7 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.67 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5167  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0321  hypothetical protein  30.25 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0544  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.35 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.996165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.97 
 
 		 807 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.44 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.57 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  25 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  25.71 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6240  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.3 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4335  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.73 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.81 
 
 		 804 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  25.32 
 
 		 1089 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  24.7 
 
 		 208 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0596  hypothetical protein  27.56 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6324  hypothetical protein  27.68 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.58 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1974  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.79 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0180  hypothetical protein  23.08 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0133176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2355  relaxase/mobilization nuclease  22.62 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149607  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.48 
 
 		 1088 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  24.63 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>