33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0361 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  64.11 
 
 		 807 aa  983    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 804 aa  1650    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  47.69 
 
 		 208 aa  181  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  37.65 
 
 		 404 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  36.36 
 
 		 402 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  37.35 
 
 		 413 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  37.05 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1610  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.68 
 
 		 444 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  34.16 
 
 		 438 aa  152  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.53 
 
 		 392 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.71 
 
 		 279 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.53 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.75 
 
 		 306 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  28.85 
 
 		 307 aa  91.7  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0180  hypothetical protein  26.34 
 
 		 484 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0133176 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.71 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0321  hypothetical protein  28.69 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4335  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.81 
 
 		 519 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.13 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.46 
 
 		 315 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.3 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.89 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  34.07 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.11 
 
 		 303 aa  60.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1513  hypothetical protein  25.87 
 
 		 477 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.734399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.44 
 
 		 464 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.64 
 
 		 431 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  24.51 
 
 		 443 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.87 
 
 		 440 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4407  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.47 
 
 		 546 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.81 
 
 		 426 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  26.21 
 
 		 752 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.12 
 
 		 414 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>