21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0766 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 521 aa  1075    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  30.72 
 
 		 752 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  29.86 
 
 		 746 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  30.06 
 
 		 746 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  28.3 
 
 		 873 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  29.7 
 
 		 713 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  28.9 
 
 		 830 aa  170  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  26.06 
 
 		 650 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.96 
 
 		 743 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  25.23 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  24.36 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  21.49 
 
 		 805 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.03 
 
 		 843 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  21.85 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  27.72 
 
 		 899 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  29.07 
 
 		 899 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  24 
 
 		 303 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.57 
 
 		 398 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25.4 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.89 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3685  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.68 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>