28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0058 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  70.53 
 
 		 657 aa  932    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 899 aa  1877    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  98.67 
 
 		 899 aa  1853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  33.33 
 
 		 650 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  32.58 
 
 		 651 aa  201  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  28.87 
 
 		 805 aa  115  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  28.63 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  36.5 
 
 		 743 aa  101  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.69 
 
 		 635 aa  101  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  27.2 
 
 		 752 aa  99.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  25.21 
 
 		 830 aa  92.4  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  25.86 
 
 		 746 aa  90.9  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  24.82 
 
 		 746 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  40.62 
 
 		 650 aa  89.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  25.83 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.8 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  45 
 
 		 843 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  40 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  38.95 
 
 		 557 aa  67.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.07 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.42 
 
 		 659 aa  62  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.9 
 
 		 392 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.9 
 
 		 392 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.13 
 
 		 458 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  31 
 
 		 443 aa  48.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.67 
 
 		 306 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0050  relaxase  25.5 
 
 		 443 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.699797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  30.3 
 
 		 307 aa  45.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>