13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0072 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  70.53 
 
 		 899 aa  952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  70.38 
 
 		 899 aa  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  100 
 
 		 657 aa  1360    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  36.78 
 
 		 650 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  37.85 
 
 		 651 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  28.21 
 
 		 805 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.89 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.61 
 
 		 659 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  25.38 
 
 		 746 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  25.68 
 
 		 746 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  24.5 
 
 		 713 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  36.59 
 
 		 752 aa  44.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  29.13 
 
 		 830 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>