26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0373 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  100 
 
 		 650 aa  1343    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  29.51 
 
 		 830 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.06 
 
 		 521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  28.72 
 
 		 713 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  47.55 
 
 		 746 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  47.55 
 
 		 746 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  34.64 
 
 		 752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  48.84 
 
 		 873 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  25.47 
 
 		 805 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.97 
 
 		 843 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.29 
 
 		 743 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  40.62 
 
 		 899 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  39.84 
 
 		 899 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.24 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  31.9 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  31.9 
 
 		 651 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.92 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  29.37 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.39 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.5 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.9 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0745  hypothetical protein  37.18 
 
 		 154 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.88 
 
 		 306 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1758  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.04 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.562908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0832  relaxase/mobilization nuclease family protein  40.98 
 
 		 455 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  25 
 
 		 315 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>