27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0026 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  100 
 
 		 873 aa  1793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  53.39 
 
 		 830 aa  599  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  43.91 
 
 		 752 aa  572  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  44.67 
 
 		 746 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  44.23 
 
 		 746 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  38.37 
 
 		 713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.3 
 
 		 521 aa  184  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  48.84 
 
 		 650 aa  138  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  26.22 
 
 		 805 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  26.03 
 
 		 651 aa  125  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  25.66 
 
 		 650 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  23.68 
 
 		 635 aa  98.2  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.05 
 
 		 659 aa  97.8  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  23.33 
 
 		 743 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.92 
 
 		 303 aa  92.8  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  25.83 
 
 		 899 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  24.58 
 
 		 899 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.27 
 
 		 843 aa  77.8  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3769  hypothetical protein  43.82 
 
 		 221 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330863  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.78 
 
 		 557 aa  60.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0745  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.43 
 
 		 281 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  21.88 
 
 		 307 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6701  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.75 
 
 		 440 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.201149 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.9 
 
 		 1019 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0329  hypothetical protein  36.14 
 
 		 623 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  35.11 
 
 		 1255 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>