12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0745 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  44.44 
 
 		 830 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  46.67 
 
 		 713 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  38.46 
 
 		 746 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  38.46 
 
 		 746 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  41.67 
 
 		 873 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  37.18 
 
 		 650 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  34.62 
 
 		 752 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  38.89 
 
 		 805 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  41.07 
 
 		 899 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.05 
 
 		 521 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  39.29 
 
 		 899 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>