29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4671 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  100 
 
 		 713 aa  1483    Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  40.73 
 
 		 746 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  40.46 
 
 		 746 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  39.55 
 
 		 752 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  38.37 
 
 		 873 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  39.43 
 
 		 830 aa  376  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.7 
 
 		 521 aa  180  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  28.72 
 
 		 650 aa  154  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  26.14 
 
 		 805 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  24.95 
 
 		 651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  24.32 
 
 		 650 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  26.88 
 
 		 743 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  22.41 
 
 		 659 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  36.49 
 
 		 899 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  36.49 
 
 		 899 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.5 
 
 		 843 aa  87  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  23.68 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0745  hypothetical protein  46.67 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  20.9 
 
 		 635 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  21.52 
 
 		 281 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  26.7 
 
 		 398 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  25.19 
 
 		 307 aa  55.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  28.4 
 
 		 557 aa  54.3  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3769  hypothetical protein  32.18 
 
 		 221 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330863  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.97 
 
 		 1019 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  24.1 
 
 		 657 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0329  hypothetical protein  30.48 
 
 		 623 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4407  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.29 
 
 		 546 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4629  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.29 
 
 		 545 aa  43.9  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>