23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7564 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 1019 aa  2051    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0051  relaxase  39.42 
 
 		 1201 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0037  relaxase  38.59 
 
 		 1065 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08174  relaxase NikB  36.23 
 
 		 977 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  25.97 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0949  aminotransferase  27.95 
 
 		 816 aa  57.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0482781  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  30.99 
 
 		 918 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.35 
 
 		 828 aa  54.7  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  37.11 
 
 		 843 aa  54.3  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4600  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.99 
 
 		 281 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  25 
 
 		 873 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0005  mobilization protein  25.91 
 
 		 535 aa  50.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  26.98 
 
 		 805 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_010485  EcSMS35_B0002  mobilization protein MbeA  24.17 
 
 		 517 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011082  SeHA_B0003  mobilization protein MbeA  24.24 
 
 		 524 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  30.97 
 
 		 752 aa  49.7  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3938  hypothetical protein  29.5 
 
 		 419 aa  49.7  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255208 
 
 
-
 
NC_009791  EcE24377A_A0003  mobilization protein MobA  25 
 
 		 521 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  31.25 
 
 		 746 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  31.25 
 
 		 746 aa  48.5  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  25.35 
 
 		 651 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  24.92 
 
 		 650 aa  45.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2404  hypothetical protein  29.53 
 
 		 348 aa  45.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>