165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1462 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1462  cyclase/dehydrase  100 
 
 
130 aa  271  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.249218  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1519  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  271  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1591  cyclase/dehydrase  67.48 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01178  cyclase/dehydrase superfamily  64 
 
 
143 aa  175  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0762785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  38.98 
 
 
143 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  40.16 
 
 
144 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  45.31 
 
 
148 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  37.4 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  39.83 
 
 
144 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  36.59 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  39.34 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  38.52 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  34.96 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  38.98 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  36.59 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  36.59 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  36.59 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  35.77 
 
 
145 aa  95.9  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  34.15 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  35.77 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  40.98 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  35.77 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  42.37 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  35.48 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  34.15 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1144  cyclase/dehydrase  37.4 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  40.16 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  38.52 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  42.62 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  35.48 
 
 
145 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  36.89 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  40 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  37.7 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  36.89 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  37.4 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  39.13 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  34.68 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  36.89 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  36.07 
 
 
157 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  37.7 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  33.06 
 
 
145 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  38.98 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  34.96 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  37.21 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  33.06 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  42.62 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  34.96 
 
 
143 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  34.15 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  36.07 
 
 
144 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  35.94 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  35.94 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2341  cyclase/dehydrase  33.61 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.131655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  34.75 
 
 
158 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  37.29 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  37.29 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  37.29 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  37.29 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  34.75 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  34.75 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  34.75 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2626  cyclase/dehydrase  32.79 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  36.44 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  36.44 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  36.44 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  32.2 
 
 
175 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  36.44 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  34.75 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  33.9 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  35.59 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0280  hypothetical protein  35.25 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0456  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  34.43 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  33.05 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>