49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3069 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3069  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 229 aa  437  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 268 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  38.89 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  22.41 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  29.75 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  28.4 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  29.89 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  32 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 271 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 242 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 279 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>