More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2559 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2559  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
281 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  59.22 
 
 
284 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09030  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  62.72 
 
 
297 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0104507  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2350  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  60.42 
 
 
287 aa  279  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0300019  hitchhiker  0.0000332154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53.62 
 
 
293 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8192  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  54.98 
 
 
301 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.65 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.98 
 
 
298 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2017  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.21 
 
 
297 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6346  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.69 
 
 
296 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.191715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5899  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.48 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.49 
 
 
279 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4210  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.96 
 
 
302 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.18 
 
 
270 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1445  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.65 
 
 
283 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1118  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.9 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000464599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2097  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.97 
 
 
280 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0940  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.5 
 
 
283 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.24 
 
 
285 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.97 
 
 
276 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.53 
 
 
284 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.53 
 
 
284 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2048  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.02 
 
 
300 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.16 
 
 
284 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1125  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.9 
 
 
284 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.110653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.53 
 
 
284 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1299  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.16 
 
 
284 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.5 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.15 
 
 
294 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.15 
 
 
294 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06100  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.37 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.127581  normal  0.398775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.5 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1112  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.16 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0345479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1054  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.5 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.91 
 
 
278 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.64 
 
 
284 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.29 
 
 
280 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13295  dTDP-6-deoxy-L-lyxo-4-hexulose reductase rmlD  45.42 
 
 
304 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10261  normal  0.625833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.31 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1207  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.49 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.81 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.63 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0187  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.73 
 
 
270 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.43 
 
 
296 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_002950  PG1561  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.72 
 
 
285 aa  175  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1853  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.06 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00990  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.03 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.28 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.11 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.99 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4330  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.21 
 
 
298 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.42 
 
 
285 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4467  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.6 
 
 
287 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.84 
 
 
461 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.00000000841547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.14 
 
 
278 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.29 
 
 
287 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0418  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.51 
 
 
288 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.35 
 
 
298 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.97 
 
 
296 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.96 
 
 
293 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.45 
 
 
237 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5788  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.71 
 
 
290 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1285  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.65 
 
 
301 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0205  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.5 
 
 
313 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.64 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1270  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40 
 
 
246 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1319  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.64 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1336  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.64 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1355  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.64 
 
 
287 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00158528  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.49 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13108  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.42 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3287  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.49 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1493  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.29 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1984  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.29 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1488  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.1 
 
 
306 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.82 
 
 
291 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.65 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.04 
 
 
298 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.09 
 
 
291 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1006  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.28 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.57 
 
 
282 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.27 
 
 
294 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0627  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.41 
 
 
287 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4736  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.5 
 
 
274 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.377015  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2549  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.94 
 
 
292 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.58 
 
 
296 aa  159  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00037704  normal  0.832838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.18 
 
 
291 aa  159  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0900  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.34 
 
 
278 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-32 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1777  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.62 
 
 
297 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309718  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1062  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.93 
 
 
321 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.64 
 
 
286 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.657644  hitchhiker  0.00910437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.82 
 
 
291 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0881  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.68 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.05 
 
 
287 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.87 
 
 
286 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.59 
 
 
285 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2718  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.54 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.82 
 
 
292 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.22 
 
 
303 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.289187  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08561  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.93 
 
 
297 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>