35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2515 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  798    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  39.15 
 
 
470 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  35.6 
 
 
514 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  36.34 
 
 
414 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  32.71 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  34.25 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  33.98 
 
 
479 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  35.13 
 
 
370 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  34.15 
 
 
360 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  33.52 
 
 
384 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  33.24 
 
 
394 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  33.61 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  33.61 
 
 
398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  33.61 
 
 
398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  37.16 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  31.31 
 
 
335 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  33.52 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  32.81 
 
 
294 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  33.03 
 
 
362 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  33.02 
 
 
451 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  32.58 
 
 
336 aa  103  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  31.68 
 
 
375 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  30.56 
 
 
390 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  29.39 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  29.41 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  60.66 
 
 
224 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  28.79 
 
 
348 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  30.11 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  35.17 
 
 
190 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  27.13 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0071  hypothetical protein  27.2 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  29.63 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0095  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  58.7 
 
 
214 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  36.99 
 
 
323 aa  43.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>