26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0453 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  659    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  35.45 
 
 		 439 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  28.62 
 
 		 428 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  31.79 
 
 		 294 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.91 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  29.58 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  34.08 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  32.18 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  30.79 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  26.52 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  28.12 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  28.16 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  30.49 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  27.36 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  27.02 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  28.03 
 
 		 470 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  29.1 
 
 		 422 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  24.62 
 
 		 479 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  27.45 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  24.84 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  32.71 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  26.32 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>