28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3907 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  31.73 
 
 		 428 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  32.64 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  32.16 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  31.97 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  31.97 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  29.43 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  32.69 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  30.88 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  32.65 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  31.54 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  34.38 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  32.51 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  33.55 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  28.11 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  32.94 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.75 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  32.7 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  31.65 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  29.09 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  31.45 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  28.49 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  30.05 
 
 		 479 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  26.1 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  29.5 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  32.43 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  29.25 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>