38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4857 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  99.75 
 
 		 398 aa  750    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  100 
 
 		 398 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  100 
 
 		 398 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  59.65 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  58.51 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  55.76 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  36.41 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  39.7 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  34.54 
 
 		 514 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  33.82 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  31.88 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  31.66 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  31.83 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  35.47 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  32.15 
 
 		 362 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  34.2 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  33.03 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  34.22 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  34.74 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  33.67 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  32.8 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  27 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  31.33 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  30.48 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  33.23 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  29.66 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  30.49 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  56.72 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  47.95 
 
 		 830 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0583  putative lipoprotein  42.59 
 
 		 754 aa  51.2  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  43.16 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  47.22 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  28.83 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0585  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 111 aa  46.6  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1821 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15910  hypothetical protein  54.72 
 
 		 568 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04719  conserved hypothetical protein similar to Rho guanine nucleotide exchange factor (Eurofung)  32.18 
 
 		 1199 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>