33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13720 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  100 
 
 		 451 aa  858    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  53.47 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  53.21 
 
 		 398 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  53.21 
 
 		 398 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  51.06 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  43.31 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  37.44 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  36.02 
 
 		 514 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  38.79 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  33.77 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  29.29 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  33.43 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  34.29 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  34.86 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  38.87 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  30.43 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  32.15 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  34.75 
 
 		 335 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  31.1 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  32.57 
 
 		 294 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  30.13 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  32.96 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.26 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  32.48 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  31.83 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  29.37 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  31.95 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  28.85 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1821 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  26.38 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  32.18 
 
 		 1646 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0622  hypothetical protein  24.88 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0046  hypothetical protein  30.88 
 
 		 321 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0958603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>