35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2497 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  807    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  32.33 
 
 		 514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  33.85 
 
 		 362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  32.47 
 
 		 479 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  29.59 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  31.67 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  33.43 
 
 		 360 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  30.23 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  28.97 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  28.43 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  30.36 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  35.24 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  32.43 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  32.43 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  32.43 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  33.23 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  34.71 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  36.12 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  28.93 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  31.01 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  26.54 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  29.51 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.66 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  35.15 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  32 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  27.86 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  49.09 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  35.14 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  27.99 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  27.41 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  25.55 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1821 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.48 
 
 		 2914 aa  43.5  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>