37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  885    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  35.28 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  42.37 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  35.38 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  32.95 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  31.73 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  29.5 
 
 		 360 aa  123  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  33.74 
 
 		 331 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  34.44 
 
 		 335 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  30.59 
 
 		 384 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  31.23 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  30.91 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  30.91 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  32.56 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  33.54 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  30.03 
 
 		 362 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  32.92 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  32.06 
 
 		 294 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  30.16 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  30.52 
 
 		 336 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  31.05 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  27.19 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  27.5 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  29.1 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  26.96 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  31.62 
 
 		 335 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  31.85 
 
 		 1889 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.660291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  28.71 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32 
 
 		 2851 aa  52  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  29.65 
 
 		 284 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  31.25 
 
 		 2397 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  38.89 
 
 		 322 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  40 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  25.93 
 
 		 296 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  31.13 
 
 		 285 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 1131 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0616  hypothetical protein  51.06 
 
 		 712 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>