38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  35.42 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  33.23 
 
 		 439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  37.59 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.69 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  33.01 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  32.31 
 
 		 377 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  34.08 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  32.05 
 
 		 422 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  30.96 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  29.64 
 
 		 514 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  33 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  33 
 
 		 398 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  33 
 
 		 398 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  29.45 
 
 		 479 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  30.92 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  31.09 
 
 		 451 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  28.97 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  28.48 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  25.32 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  30.06 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  23.68 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  28.53 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  28.3 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  34.42 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  28.98 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  28.62 
 
 		 405 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  27.27 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0234  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2674  hypothetical protein  37.36 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  21.79 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6114  hypothetical protein  27.03 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  25.9 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0087  hypothetical protein  24.73 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>