10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4960 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0234  hypothetical protein  26.55 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  26.94 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  23.94 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  28.3 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  31.43 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  23.18 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  32.22 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2674  hypothetical protein  28.86 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  23.95 
 
 		 514 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>