30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0762 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  100 
 
 		 335 aa  628  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  64.01 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  35.27 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  32.69 
 
 		 439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  33.89 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  32.25 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  31.28 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  30.45 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  30.83 
 
 		 514 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  35.99 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  30.53 
 
 		 479 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  30.62 
 
 		 428 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  32.58 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  33.23 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  32.58 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  32.58 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  30.03 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  27.11 
 
 		 414 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  31.13 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  30.7 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  30.6 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.98 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  32.34 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  31.66 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  28.86 
 
 		 430 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  25.93 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  28.77 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  31.58 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  23.18 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  24.19 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>