36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1829 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  813    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  33.7 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  30.13 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  35.19 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  26.35 
 
 		 439 aa  126  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  30.96 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  28.85 
 
 		 479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.19 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  29.97 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  28.31 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  31.38 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  31.38 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  31.38 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  31.06 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  28.77 
 
 		 384 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  29.19 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  28.88 
 
 		 294 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  27.01 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  29.38 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  24.6 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  35 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  25.6 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  29.15 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  28.01 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  25.3 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  39.53 
 
 		 1612 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.78 
 
 		 2272 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30 
 
 		 2179 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  27.74 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  34.72 
 
 		 218 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  28.63 
 
 		 284 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  30.51 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  25.96 
 
 		 1646 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  32.62 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>