33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1442 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  859    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  37.46 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  39.58 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  36.19 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  36.19 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  36.19 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  39.41 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  32.9 
 
 		 514 aa  156  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  33.24 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  31.83 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  39.88 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  35.75 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  34.22 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  32.14 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  35.85 
 
 		 331 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  32.95 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  35.38 
 
 		 348 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  31.68 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  29.51 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  32.16 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  34.6 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  25.59 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  29.23 
 
 		 362 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  28.96 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.98 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  29.59 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  29 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  26.16 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4196  hypothetical protein  32.21 
 
 		 323 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  42.11 
 
 		 276 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3261  hypothetical protein  32.14 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0234  hypothetical protein  33.72 
 
 		 294 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>